每經(jīng)編輯 孫志成    

新冠病毒是否已經(jīng)發(fā)生突變？如何突變？這是目前學(xué)界研究的焦點(diǎn)之一。

3月3日，中國(guó)科學(xué)院主辦的《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》（National Science Review）發(fā)表題為《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》的論文，通過對(duì)迄今最大規(guī)模的新冠病毒全基因組分子進(jìn)化分析，揭示了新冠病毒已經(jīng)演化出L和S兩個(gè)亞型。其中S型是相對(duì)更古老的版本，而L亞型更具侵略性傳染力更強(qiáng)。對(duì)不同亞型的深入了解，將有助于新冠肺炎的差異化的治療和防控。

研究發(fā)現(xiàn)新冠病毒演化出兩個(gè)亞型

中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)最新發(fā)現(xiàn)顯示：新冠病毒已于近期產(chǎn)生了149個(gè)突變點(diǎn)，并演化出了兩個(gè)亞型，分別是L亞型和S亞型。研究發(fā)現(xiàn)，在地域分布及人群中的比例，這兩個(gè)亞型表現(xiàn)出了很大測(cè)差異。

以上研究來自中國(guó)科學(xué)院主辦的《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》（National ScienceReview）于3月3日發(fā)表的論文《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》（On the origin andcontinuing evolution of SARS-CoV-2）。

論文通訊作者為陸劍研究員（北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心）、崔杰研究員（中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所）。

在這103個(gè)病毒株中，有101個(gè)屬于兩個(gè)亞型之一。具體而言，兩個(gè)亞型的區(qū)別在于病毒RNA基因組的第28144位點(diǎn)，L型是T堿基（對(duì)應(yīng)亮氨酸，Leu），S型是C堿基（對(duì)應(yīng)絲氨酸，Ser）。通過與其他冠狀病毒比較，作者發(fā)現(xiàn)S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進(jìn)化樹上更接近，從而得出S型相對(duì)更古老的結(jié)論。

兩種新冠病毒亞型在時(shí)間和空間分布上存在差異（圖片來源：論文截圖）

但研究人員意外發(fā)現(xiàn)，相對(duì)古老的S型新冠病毒并沒有因?yàn)樵谌巳褐袀鞑サ臅r(shí)間更長(zhǎng)，而感染更多的人?；蚪M數(shù)據(jù)表明，感染S型的比例占30%，反倒是相對(duì)年輕的L型新冠病毒的感染比例占70%，而且每個(gè)L型病毒株比S型攜帶了相對(duì)更多的新生突變。

基于上述反常現(xiàn)象，作者推測(cè)：“L型病毒傳播能力更強(qiáng)，或者在人體內(nèi)復(fù)制更快，因此可能意味著其毒力也更大。”

作者還專門比較了1月7日前后S型和L型所占比例的變化，他們發(fā)現(xiàn)L型在病毒株中的比例下降，S型比例上升。作者由此推測(cè)：“這可能是因?yàn)長(zhǎng)型病毒的患者更容易表現(xiàn)出癥狀，因而更容易受到人工干預(yù)，從而使L型新冠病毒受到的負(fù)選擇壓力更大，感染的人數(shù)由此變少。”

 103個(gè)新冠病毒毒株的進(jìn)化樹（圖片來源：論文截圖）

L亞型在武漢爆發(fā)的早期階段更為普遍，而L亞型的發(fā)生頻率在2020年1月初后有所下降。作者認(rèn)為，人為干預(yù)可能對(duì)L亞型施加了更大的選擇性壓力，如果沒有這些干預(yù)，L亞型可能更具侵略性和擴(kuò)散得更快速。另一方面，由于選擇壓力相對(duì)較弱，在進(jìn)化上較老且攻擊性較小的S型可能在相對(duì)頻率上有所增加。這些發(fā)現(xiàn)意味著，目前迫切需要結(jié)合基因組數(shù)據(jù)、流行病學(xué)數(shù)據(jù)和2019年冠狀病毒病患者臨床癥狀圖表記錄，進(jìn)行進(jìn)一步的全面研究。

103個(gè)新冠病毒毒株的衍生突變頻譜分析，橘黃色為非同義突變、綠色為同義突變

（圖片來源：論文截圖）

另外，值得注意的是，這103個(gè)樣本顯示，大部分患者只感染了L亞型或S亞型中的一個(gè)。但其中一位近期有過武漢旅行史的美國(guó)患者分離出的病毒株，這兩個(gè)位點(diǎn)卻均呈現(xiàn)了C和T的混合現(xiàn)象，也就是說，很有可能這位患者同時(shí)感染了L型和S型新冠病毒。不過，作者表示目前還無法排除新突變型的可能性。

巴西患者病毒基因有3處突變

巴西在2月26日出現(xiàn)首例確診病例。當(dāng)?shù)乜茖W(xué)家與英國(guó)科學(xué)家合作，緊急針對(duì)該名61歲的巴西患者進(jìn)行“冠狀病毒基因定序”，結(jié)果發(fā)現(xiàn)這名患者體內(nèi)的新冠病毒同武漢公布的病毒基因相比存在3處不同，表示病毒在傳播過程中已經(jīng)發(fā)生突變。

據(jù)南方都市報(bào)，3月1日，一份發(fā)表在病毒學(xué)國(guó)際交流平臺(tái)（Virological），題為《First report of COVID-19 in South America》（南美洲首例新型冠狀病毒報(bào)告）引發(fā)關(guān)注，這是南美洲首次分析出新冠病毒的基因序列，由巴西Adolfo Lutz國(guó)家研究所、國(guó)家參考實(shí)驗(yàn)室，以及圣保羅大學(xué)（USP）、牛津大學(xué)熱帶醫(yī)學(xué)研究所共同完成。

據(jù)報(bào)告介紹，該名巴西首例確診新冠肺炎患者為61歲男性，來自圣保羅市。他于2020年2月9-21日，曾前往意大利北部的倫巴第旅游。在返回巴西后，他出現(xiàn)發(fā)燒和呼吸道癥狀，包括干咳、喉嚨痛、流鼻涕等。2月25日，他在圣保羅阿爾伯特·愛因斯坦醫(yī)院進(jìn)行了新冠肺炎的診斷篩查，26日確診為新冠肺炎患者。

研究人員從該名患者的鼻咽中提取病毒基因，進(jìn)行“冠狀病毒基因定序”，原本需要花15天的工程，在48小時(shí)內(nèi)完成。

報(bào)告指出，初步的遺傳分析表明，這株巴西“Brazil/SPBR1/2020”病毒的基因組，跟中國(guó)此前公布的 “Hu-1參考菌株”有3處不同，表示病毒在傳播的過程中已經(jīng)開始突變。而這些突變中，有兩處跟德國(guó)慕尼黑群聚傳染事件中提取的病毒“德國(guó)/ BavPat1/2020菌株”非常接近。這個(gè)結(jié)果表示，在歐洲傳播的新冠病毒已經(jīng)跟原本在中國(guó)傳播的病毒有所不同。

據(jù)看看新聞，研究團(tuán)隊(duì)表示，目前意大利只公布了一個(gè)病毒基因組序列，來自一位東亞地區(qū)的女游客，屬于 “境外輸入病毒 ”。但隨著確診病例越來越多，有必要針對(duì)意大利本土病例重新進(jìn)行病毒分析。“意大利北部的倫巴第地區(qū)，正好是出現(xiàn)第一例意大利本土病例的地方，所以我們分析的病毒基因或許可以代表新的發(fā)現(xiàn)，包括病毒的變異。”

研究團(tuán)隊(duì)將這份資料公開，希望各國(guó)能共享研究成果，避免病毒在大家不清楚其已變異的情況下傳播，引發(fā)更多不確定的突變。

每日經(jīng)濟(jì)新聞綜合 看看新聞、南方都市報(bào)、第一財(cái)經(jīng)、北京晚報(bào)等

封面圖片來源：攝圖網(wǎng)